• богословское осмысление творения мира и человека;
• соотношение науки и веры;
• издание материалов, облегчающих понимание текстов Священного Писания, используемых в богослужении

Комиссия по вопросам церковного управления и механизмов осуществления соборности в Церкви:

• процедура и критерии избрания кандидатов во епископы;
• митрополичьи округа как форма церковного устройства;
• границы приходов и членство в приходе;
• вопросы обеспечения учительного, административного, информационного и экономического единства церковного управления

Комиссия по вопросам церковного права:

• о границах применения современных технологий для подтверждения чудесных явлений и почитаемых событий;
• кодификация источников церковного права;
• упорядочение практики совершения браков (в частности повторных);
• принципы интерпретации канонов;
• церковно-судебная практика;
• отношение к кремации;
• дисциплина поста

Комиссия по вопросам богослужения и церковного искусства:

• упорядочение практики совершения уставного богослужения;
• литургические тексты и чинопоследования;
• эстетика богослужения;
• общецерковное богослужебное предание и местные богослужебные обычаи;
• богослужения в памятные исторические даты;
• Причащение и совершение приходских треб;
• богослужебный репертуар церковных хоров с точки зрения истории и современной практики;
• миссионерско-катехизическое значение православного богослужения для проповеди христианства в современном мире;
• вопрос о молитве за самоубийц и некрещеных;
• выработка норм в области вопроса о церковной архитектуре (строительстве и реставрации), иконописи, церковном пении и колокольном звоне

Комиссия по вопросам приходской жизни и приходской практики:

• негативные явления в современной приходской жизни, способы их преодоления;
• приходская практика требоисполнения и пожертвования за требы;
• духовничество и духовническая практика в современных условиях, епитимийная практика, соотношение икономии и акривии, разработка руководства к совершению исповеди для священников;
• негативные явления в современной приходской жизни, способы их преодоления;
• разработка правил этикета для священно- и церковнослужителей;
• организация епархиальной и приходской жизни церковной диаспоры Московского Патриархата в дальнем зарубежье;
• совершенствование организации приходской финансовой системы

Комиссия по вопросам организации церковной миссии:

• вопросы катехизации для взрослых, приступающих к Таинству Крещения, а также для родителей и восприемников крещаемых детей;
• миссионерство среди тех, кто, будучи крещеным, не участвует в церковной жизни;
• современное миссионерское служение в среде нехристиан;
• миссионерские задачи зарубежных приходов Русской Православной Церкви;
• церковная экспертиза новых миссионерских программ;
• совершенствование подготовки миссионеров на базе существующих учебных заведениях;
• формы организации работы с молодежью на общецерковном, епархиальном и приходском уровне;
• проблематика миссии в условиях церковного раскола на Украине;
• миссия в социальных, образовательных и исправительных учреждениях;
• развитие Миссионерской концепции Русской Православной Церкви

Комиссия по вопросам организации жизни монастырей и монашества:

• юридические аспекты поступления в монастырь и ухода из него;
• случаи оставления монастыря: канонические и дисциплинарные прещения, виды епитимий, сложение сана и лишение монашества; возможность вступления в брак, вопрос возможности причащения оставивших монашество, условия возвращения в монастырь;
• вопрос о должности игумена (настоятеля) монастыря и титуле игумена как богослужебной награды;
• положение о монастырях и монашестве;
• внутренний устав монастырей;
• священнослужение монахов в женских монастырях и на приходах;
• практика откровения помыслов в монастырях, духовное руководство монашествующими и мирянами в монастырях;
• случаи оставления монастыря и монашества

Комиссия по вопросам духовного образования и религиозного просвещения:

• вопрос о рукоположении лиц, не имеющих законченного духовного образования;
• финансирование духовных учебных заведений;
• дополнительное образование, специальная подготовка, повышение квалификации клириков и иных церковных работников Русской Православной Церкви;
• разработка базовых модулей стандарта программы подготовки работников сферы катехизации;
• подготовка клириков и церковных специалистов в сфере образования;
• вопрос о рукоположении лиц, не имеющих законченного духовного образования;
• выработка мер по более эффективному использованию в Церкви священнослужителей, обладающих фундаментальной богословской подготовкой;
• возможности государственного финансирования духовных учебных заведений и православных общеобразовательных школ (гимназии, лицеи и т.п.);
• миряне в области религиозного просвещения;
• введение ОПК, преподавание религии в системе общего светского образования, подготовка соответствующих учебных пособий и педагогических кадров;
• обобщение имеющегося опыта и методов работы в сфере катехизации с целью создания практических рекомендаций

Комиссия по вопросам организации церковной социальной деятельности и благотворительности:

• создание концепции социальной и благотворительной деятельности Русской Православной Церкви;
• поддержка семьи, материнства и детства;
• благотворительность и социальная деятельность на общецерковном, епархиальном, приходском уровнях;
• разработка подходов к осуществлению церковной заботы о престарелых, инвалидах, детях-сиротах, малоимущих;
• борьба с алкогольной угрозой и наркотической зависимостью

Комиссия по вопросам взаимодействия Церкви, государства и общества:

• позиция Церкви по проблемам, волнующим современное общество;
• развитие социального учения Русской Православной Церкви;
• вопросы общественной морали;
• взаимодействие Церкви и мира науки;
• взаимодействие Церкви и культуры;
• Церковь и экономика;
• вопросы биоэтики;
• соотношение церковного и светского права;
• вопросы законодательства в странах СНГ и Балтии;
• взаимодействие Церкви и Вооруженных сил, правоохранительных органов, государственной системы исполнения наказаний;
• вопросы глобализации: международные отношения, проблемы политической, экономической и культурной глобализации;
• выработка концепции Русской Православной Церкви по проблемам экологии;
• взаимоотношения церковного Священноначалия и православных общественных объединений;
• Церковь и политические партии;
• выработка церковной позиции в отношении идентификации предполагаемых останков Царской семьи, найденных под Екатеринбургом;
• позиции Русской Православной Церкви по ювенальной юстиции

Комиссия по вопросам противодействия церковным расколам и их преодоления:

• богословский и канонический анализ современных расколов;
• вопрос о церковном поминовении лиц, находящихся в расколе;
• икономия и акривия в признании таинств, совершаемых в раскольнических сообществах

Комиссия по вопросам отношения к инославию и другим религиям:

• оценка современного состояния межхристианского диалога;
• концепция участия Русской Православной Церкви в межрелигиозных и межхристианских организациях, в многосторонних и двусторонних диалогах с инославными церквами;
• вопрос рецепции документов, которые Церковь обсуждает или принимает на межхристианских и межрелигиозных диалогах;
• сотрудничество с инославными в вопросах диаконии и образования;
• молитвы за живых и усопших инославных христиан;
• допустимые формы общения представителей Церкви с инославными;
• правила и практики присоединения инославных к Церкви;
• проблематика двустороннего диалога с древневосточными Церквами, католиками и протестантами;
• вопрос смешанных браков;
• разработка концепции Русской Православной Церкви в отношении других религий

Комиссия по вопросам информационной деятельности Церкви и отношений со СМИ:

• информационная политика Церкви;
• церковные СМИ как общественно значимые инструменты;
• роль СМИ в урегулирования конфликтных ситуаций;
• вопрос ответственности журналистов