Новосибирская епархия Русской Православной Церкви в настоящее время территориально совпадает с Новосибирской областью. В 105 приходах епархии совершают богослужение 160 священников и 41 диакон.

С 19 августа 1990 года и до июля 1995 года и с декабря 2000 года епархией управляет Высокопреосвященнейший архиепископ Новосибирский и Бердский Тихон. Святительство Владыки Тихона в Новосибирске началось и продолжается тогда, когда перед Церковью встали новые сложнейшие задачи восстановления и строительства храмов, налаживания жизни монастырей епархии, возрождения традиций образовательного, просветительного, благотворительного, миссионерского и церковно-общественного служения. Многое было сделано за эти годы.

Буквально с первых дней своего служения на Новосибирской кафедре Владыка Тихон заботился о пополнении числа священнослужителей, миссионеров, преподавателей приходских школ подготовленными кандидатами. По его благословению начали свою деятельность Духовная семинария в Томске и Православный Богословский институт в Новосибирске. В настоящее время в Новосибирской епархии проходят занятия в 60 приходских школах, где дети и взрослые изучают основы веры, богослужения и православной культуры. Уже состоялось несколько выпусков в двух Православных гимназиях — средних негосударственных общеобразовательных учебных заведениях под церковным попечительством, существующих при Знаменском храме в Новосибирске и храме в честь Всех Святых в земле Российской просиявших в Академгородке.

Новосибирская епархия активно сотрудничает с Управлением образования области. По благословению архиепископа Тихона ежегодно проходят Рождественские образовательные чтения, позволяющие священно служителям, новосибирским ученым и педагогам вести активный диалог и обмениваться опытом. В Новосибирске издано хорошо иллюстрированное специальное учебное пособие-хрестоматия по Основам православной культуры. Преподавание этого курса уже началось в некоторых учебных заведениях области. В епархии проводится активная миссионерская работа.

Несколько раз совершались поездки миссионерского поезда. Священнослужители Новосибирской епархии, деятели культуры, творческие коллективы, врачи и работники социальных служб совместно посещают отдаленные районы области. Эти миссионерские поездки организовываются при непосредственном участии и помощи Администрации Новосибирской области и Управления Западно-Сибирской железной дороги.

В 1996 году совершил свое первое плавание по Оби миссионерский теплоход "Андрей Первозванный". С тех пор почти каждое лето миссионеры совместно с медиками, работниками социальной сферы, творческими коллективами посещали удаленные прибрежные пункты  Новосибирской области. В ходе этих плаваний было крещено несколько тысяч человек, сотни людей смогли исповедоваться и причаститься Христовых Тайн, врачи вели прием больных, походная аптека снабжала население лекарствами.

До революции на территории Новосибирской области не было монастырей. В 1992 году трудами и заботами Владыки Тихона был создан Покровский Александро-Невский женский монастырь в поселке Колывань. В настоящее время в епархии 6 монастырей: 4 мужских и 2 женских.

В 1991 и 2002 году Новосибирскую епархию посетил Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II. Сибиряки тепло встречали Предстоятеля Русской Православной Церкви, визит которого способствовал возрождению духовной жизни епархии.

Милостью Божией Церковь Христова в Сибири растет и укрепляется с каждым днем. Добрые деловые отношения сложились у Новосибирской епархии с областной администрацией, поддерживающей многие епархиальные начинания.

Встречая 80-летие Новосибирской епархии, православные сибиряки надеются на обильную помощь Божию в деле устроения приходской жизни, храмостроительства, христианской проповеди, воспитании подрастающего поколения и социального служения.